माता वाराही को सप्त मातृका में स्थान मिला है। कहते हैं वे भगवान विष्णु के महावतार वाराह की महाऊर्जा हैं। कई जगह उन्हें लक्ष्मी और पृथ्वी का स्वरूप भी माना गया है। नेपाल में काठमांडू घाटी में मां वाराही को समर्पित चार वाराही मंदिरों में से सबसे प्रमुख मंदिर है यह नील वाराही मंदिर। इस मंदिर के अंदर एक स्वयंभू शिला है जो स्वयं नील वाराही का प्रतिनिधित्व करता है। इस मंदिर में कोई छत नहीं है। ऐसा कहा जाता है कि राजा विक्रम सेन के शासनकाल के दौरान, माता को यहां तांत्रिक तरीके से स्थापित किया गया था। नील वाराही मंदिर के परिसर में अष्टमातृका, भैरव और अन्य भी प्रतिमाएँ स्थापित हैं। यह प्रमुख स्थान हिंदुओं का अत्यंत महत्वपूर्ण स्थल है। बहुत से भक्त नील वाराही को धन वाराही के रूप में भी पूजते हैं। इस मंदिर से एक पालकी, सिंदूर यात्रा में भाग लेने के लिए तैयार की जाती है जहाँ तीन आँखों और चार हाथों वाली माता नील वाराही की एक छवि स्थापित की जाती है। भूमि, भवन के सुखों के अलावा यहां की पूजा धन प्राप्ति, शत्रुओं के नाश और कुंडली दोष निवारण के लिए सर्वश्रेष्ठ मानी जाती है।